福建省漳州市医院的前身是英籍埃及人巴阿美（A Fahmy）1888年创办的漳州福音医院，至今已有134周年历史。医院先后更名为漳州协和医院、福建省第六专区人民医院、龙溪专区医院、龙溪地区医院，1986年更名为漳州市医院。如今漳州市医院已是集医疗、教学、科研为一体的三级甲等综合性公立医院，是福建医科大学非行政隶属附属医院，担负着漳州地区520多万群众疑难、急危重症的救治任务。

医院目前在运行的有三个院区：芗城院区、龙文院区、朝阳分院，总占地面积230余亩，总建筑面积超22万平方米，编制床位2630张,开放床位3080张。其中：芗城院区编制床位2000张；龙文院区编制床位560张，以产科、儿科、小儿外科、生殖医学科为主；朝阳分院编制床位70张。在建的总部院区，占地245亩，规划设置床位2000张,按专科专病模式，主要设置有脑科中心、心脏血管中心、呼吸和胸部中心、器官移植中心、消化与腹部中心、创伤中心、肿瘤中心等，进一步满足群众对高端医疗服务的需求。2022年接管古雷分院的筹建，托管诏安县总医院、台商投资区第五医院等，推进分级诊疗，让基层老百姓在家门口就能享受优质的医疗服务。。

医院始终坚持以医疗质量为核心，注重人才培养、学科建设和技术创新，形成院有重点、科有特色、人有专长的良好格局。全院职工3421名，高级技术职称557名，其中，高级职称医师368名，福建医科大学专职教授1名，专职副教授18名，博士研究生导师1名，硕士研究生导师57名，享受国务院政府特殊津贴的专家1名，福建省卫健委有突出贡献青年专家1名。有21个职能科室，78个临床、医技科室，72个护理单元。拥有院士工作站1个，国家级名医工作室10个，省级名医工作室4个，国家药物临床试验专业机构8个，国家级住院医师规范化培训专业基地16个，国家级临床药师培训专业基地3个，普外科、产科、神经外科入选国家“首批外科基础技能提升项目市级培训基地”。  

学科建设推陈出新。目前拥有普外科、儿科、泌尿外科、呼吸内科、神经内科、神经外科、胸外科、血液内科、医学影像科等9个省级重点学科。神经外科、骨科、胸心外科、妇科、产科、消化内科、心血管内科、呼吸内科、神经内科、内分泌科、肾内科、肿瘤科、新生儿科、急诊医学科、重症医学科、康复医学科、病理科、麻醉科等18个市级重点学科，小儿外科1个市级重点专科培育专科。开展辅助生殖技术、超低出生体重新生儿救治、急性脑动脉闭塞取栓与溶栓、异基因造血干细胞移植术，微创肺癌、胃癌、结直肠癌切除术等手术，神经介入、心血管介入、肿瘤消融、超声介入以及内镜下复杂手术等高新技术蓬勃发展。