福建医科大学孟超肝胆医院是一所集医疗、教学、科研和新技术研发于一体的精专科强综合三甲医院，是福建省肝胆医学中心、福建省感染病诊疗中心和质控中心，也是国内唯一一所以吴孟超名字命名的公立三甲医院。
医院始建于1947年，现有西洪和金山2个院区，西洪院区占地47亩，功能定位全省公共卫生救治中心；金山院区占地171亩，功能定位区域肝胆胰诊疗中心和器官移植中心。拥有国家肝癌科学中心福建分中心、国家肝病与肝癌协同创新中心、中科院物构所转化医学中心、国家中医药防治感染病重点研究室、全国科学家精神教育基地等7个国家级平台和省肝胆医学中心、省肝病科学研究中心、省肝胆胰肿瘤临床医学研究中心、省联合创新重点实验室、省肝病防治新技术重大研发平台、东南肝胆健康大数据研究所、省肝病医疗联合体、省肝胆疾病防治产业技术创新研究院、省细胞治疗技术工程研究中心等13个省级平台落户医院建设，柔性引进王红阳、陈孝平2名院士（双聘）指导医院发展规划和学科建设，临床医师队伍硕博占比居国内同级和同类医院前列。
医院在肝癌及胆胰肿瘤综合治疗、肝胆胰微创治疗、三镜联合复杂肝胆管结石诊疗、肝移植、病毒性和非病毒性肝病综合治疗、肝病介入治疗、中西医结合肝病、肾脏（泌尿系统）相关疾病的内科治疗及内镜下微创治疗、新发输入型感染病等防治方面形成特色，具备与国内先进单位同步开展新技术的能力，总体水平全省领先、国内先进，并辐射我国东南部地区和东南亚国家及地区。现拥有3个国家中管局重点专（学）科（国家中西医结合肝病重点专科、国家中西医结合传染病重点专科、国家中医传染病学重点学科等）、7个省级临床重点专科或医学中心（福建省肝胆医学中心、福建省肝胆胰肿瘤临床医学研究中心、福建省感染病临床重点专科、福建省普外科（肝胆胰外科）临床重点专科、福建省消化内科（肝病与肝病介入专业）临床重点专科、福建省中医疫病临床重点专科、福建省中药制剂重点专科）、4个市级临床重点专科或医学中心（福州市感染性疾病医学中心、福州市感染病临床重点专科、福州市肿瘤临床重点专科、福州市医学检验科临床重点专科），专科排名连续5年获得复旦版全国医院声誉排行榜华东地区提名，连续6年入围全球Nature Index全国医疗机构百强，连续3年入围中国医学科学院主办的年度中国医院科技量值排行榜。并入选首批公立医院高质量发展省级试点医院、现代医院管理制度建设省级试点医院。